潘存燕主任一向严于律己，不但要求自己积极投身于医疗临床试验中，多年来积累丰富的临床经验，还认真钻研学术课题。其研究成果《脑神经递质与失眠疾病神经元损伤》、《神经肽Y在失眠发病机制中的作用研究》分别获得1993年和2002年甘肃省科技进步二等奖，除此之外还撰写《论中医在神经内科的应用》论文，刊登于全国内科学类核心期刊《中国神经精神疾病杂志》、撰写《自闭症对儿童的影响分析》，刊登于《精神医学杂志》等。